黑河市辖1个区、3个县级市、2个县、31个镇、34个乡（7个少数民族乡）、567个行政村、70个城市社区、74个城镇社区。

爱辉区：西岗子镇、爱辉镇、张地营子乡、西峰山乡、上马厂镇、四嘉子满族乡、二站乡、罕达汽镇、新生鄂伦春族乡、幸福乡、坤河达斡尔族满族乡

北安市：二井镇、石泉镇、赵光镇、海星镇、通北镇、主星朝鲜族乡、杨家乡、东胜乡、城郊乡

五大连池市：龙镇、和平镇、太平乡、建设乡、新发镇、团结镇、双泉镇、兴隆镇、朝阳山镇、兴安乡、五大连池镇（与五大连池风景名胜区自然保护区管理委员会共管）

嫩江市：前进镇、海江镇、伊拉哈镇、双山镇、长江乡、多宝山镇、嫩江镇、长福镇、科洛镇、临江乡、塔溪乡、白云乡、联兴乡、霍龙门镇

逊克县：奇克镇、逊河镇、干岔子乡、松树沟乡、车陆乡、克林镇、宝山乡、新兴鄂伦春族乡、新鄂鄂伦春族乡

孙吴县：孙吴镇、辰清镇、西兴乡、清溪乡、正阳山乡、红旗乡、奋斗乡、群山乡、卧牛河乡、沿江满族达斡尔族乡、腰屯乡